Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PKD1P98161 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PKD1P98161 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PKD1P98161 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PKD1P98161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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