Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA9P57773 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA9P57773 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms