Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAG2P55895 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAG2P55895 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAG2P55895 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms