Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB4P54760 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms