Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms