Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 525.61■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)24.87■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UNC45A-214ENST00000556704 1299 ntTSL 520.82■□□□□ 0.924e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PGGHG-205ENST00000474221 4418 ntTSL 217.64■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 ARID1B-233ENST00000637910 576 ntTSL 211.06□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.815e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.875e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 KPNA4-202ENST00000469804 790 ntTSL 239.62■■■■□ 3.932e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP48-214ENST00000532737 680 ntTSL 438.55■■■■□ 3.761e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.992e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 531.68■■■□□ 2.661e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 ZNF780B-204ENST00000594811 444 ntTSL 330.46■■■□□ 2.472e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-214ENST00000547983 1004 ntTSL 529.51■■■□□ 2.312e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.252e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 228.7■■■□□ 2.183e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-212ENST00000547746 579 ntTSL 428.51■■■□□ 2.152e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.056e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-203ENST00000460522 1703 ntTSL 227.35■■□□□ 1.972e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 DNASE1-213ENST00000576050 965 ntTSL 526.82■■□□□ 1.882e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-208ENST00000477938 1715 ntTSL 226.69■■□□□ 1.862e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP48-210ENST00000489108 443 ntTSL 226.63■■□□□ 1.853e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.842e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.813e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 326.2■■□□□ 1.783e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-203ENST00000444121 617 ntTSL 226.1■■□□□ 1.772e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.712e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.72e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-205ENST00000440827 516 ntTSL 425.46■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-205ENST00000461129 758 ntTSL 525.33■■□□□ 1.652e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)24.47■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.52e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-212ENST00000496776 656 ntTSL 324.18■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 ZNF780B-203ENST00000593605 509 ntTSL 423.91■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-209ENST00000479748 2093 ntTSL 1 (best)23.62■■□□□ 1.372e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)22.79■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SLC38A10-204ENST00000539748 528 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 522.73■■□□□ 1.233e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 222.67■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MORC3-206ENST00000492336 1290 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.211e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 LYPLAL1-211ENST00000483635 2169 ntTSL 321.53■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-211ENST00000506361 1250 ntTSL 521.53■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 12e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-204ENST00000446681 657 ntTSL 321.2■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 DNASE1-207ENST00000570769 2732 ntTSL 519.31■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 DNASE1-206ENST00000570761 897 ntTSL 518.8■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-213ENST00000547772 584 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-207ENST00000464489 5901 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PPIG-211ENST00000530152 690 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FERMT2-205ENST00000553373 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25
HNRNPMP52272 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-7■■■■□ 25
HNRNPMP52272 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 204.8 ms