Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNCAP37840 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCAP37840 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms