Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPS1P31327 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPS1P31327 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPS1P31327 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CPS1P31327 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPS1P31327 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPS1P31327 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPS1P31327 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPS1P31327 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPS1P31327 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPS1P31327 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms