Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms