Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS1P23219 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms