Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CXCL3P19876 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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