Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB1P16220 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB1P16220 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB1P16220 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms