Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms