Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms