Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2AP11388 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2AP11388 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms