Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA3O96018 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA3O96018 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
APBA3O96018 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APBA3O96018 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA3O96018 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA3O96018 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA3O96018 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms