Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24BO95487 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24BO95487 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms