Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBOX1O75936 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms