Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX5O60225 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX5O60225 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX5O60225 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX5O60225 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms