Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBAG9O00559 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms