Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms