Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms