Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVL5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVL5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVL5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVL5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVL5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVL5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms