Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQE9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQE9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQE9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms