Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms