Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms