Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSR3Q9UNL2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSR3Q9UNL2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms