Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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