Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms