Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms