Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT7Q9UIV1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT7Q9UIV1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms