Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms