Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms