Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms