Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms