Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms