Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms