Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRAMP1Q96RY5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms