Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
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