Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms