Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L4Q8WU68 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L4Q8WU68 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms