Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC43A3Q8NBI5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3Q8NBI5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms