Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms