Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD12Q8N8I0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD12Q8N8I0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms