Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms