Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 681.8 ms