Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATAD2Q6PL18 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATAD2Q6PL18 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms