Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZCCHC12Q6PEW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms