Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDZD11Q5EBL8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms