Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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